Κατά της συμφωνίας Ελλάδος και Σκοπίων, τάσσεται με ο Ευρωβουλευτής της Νέας Δημοκρατίας.
Ο Μανώλης Κεφαλογιάννης σε παρέμβασή του στην Ολομέλεια του Ευρωπαϊκού Κοινοβουλίου, στο Στρασβούργο, τόνισε πως «δεν θα λύσουμε το πρόβλημα των Σκοπίων για να δημιουργήσουμε πρόβλημα και διχασμό στη χώρα μου, την Ελλάδα».
Σχετικά με τη συμφωνία μεταξύ των πρωθυπουργών Ελλάδας και πΓΔΜ, εξέφρασε την επιθυμία του για επίλυση του προβλήματος που «εκκρεμεί εδώ και τριάντα χρόνια» υπογράμμισε όμως πως η συμφωνία είναι «ένα μνημόνιο συνεργασίας χωρίς καμία κυβερνητική απόφαση από καμία χώρα».
«Ουσιαστικά αναφέρεται σε "μακεδονικό έθνος" και "μακεδονική γλώσσα", κάτι το οποίο πρέπει να διευκρινιστεί και δεν μπορεί να γίνει αποδεκτό από κανένα», ανέφερε χαρακτηριστικά ο ευρωβουλευτής της ΝΔ.
